Es el área encargada de la ejecución de labores de programación, coordinación, supervisión y control de actividades en el ámbito administrativo para la normal prestación de los servicios de salud en la E.S.E. Hospital San Francisco. Además de llevar a cabo otras funciones especiales como:

• Desarrollar las actividades referentes a calificación de servicios y evaluación de desempeño del personal vinculado en concordancia con el Ministerio de Salud y el Departamento Administrativo de la función pública, y la comisión nacional del Servicio Civil.
• Desarrollar los programas de bienestar social y de capacitación de los empleados de la institución.
•  Realizar estudios y análisis para el desarrollo de las actividades relacionadas con la elaboración, administración y control del presupuesto.
• Elaborar el plan anual de vacaciones del personal a cargo.

Cumple funciones de Secretaria en apoyo a la gerencia y a su vez está capacitada para apoyar la elaboración de contratos para la contratación pública de la E.S.E.

Algunas de las funciones específicas son:

• Ingreso de contratos, ordenes de  pagos, suspensiones, actas de liquidación;  a la página de Gestión Transparente de la Contraloría General de Antioquia
• Realización de actos administrativos (resoluciones) apoyada por el jurídico, que rige a los servidores públicos de la E.S.E.
• Archivo de la información de contratación
• Archivo y organización hojas de vida personal de planta y contratistas
• Redacción de los oficios emitidos por la gerencia.
• Manejo del conmutador y recepción de llamadas.

Es el área Encargada de:

• Ordenar y clasificar comprobantes de contabilidad y los archivos relacionados con su labor.
• Consignar diariamente el dinero que recauda el hospital.
• Elaborar nómina y liquidar los valores correspondientes a las diferentes situaciones administrativas del personal.
• Asesorar al jefe inmediato en la determinación de prioridades presupuéstales y coordinar la formulación del presupuesto de salud del área de influencia.
• Llevar los registros del presupuesto indicando en ellos el presupuesto inicial, adiciones, disminuciones, traslados, ordenaciones, compromisos, giros, reconocimientos y recaudo mensual y acumulado de acuerdo con los códigos establecidos y otros.

El almacén es el área encargada de recepcionar, verificar y dar entrada a todos los insumos y bienes que la ESE necesita, también es el encargado del mantenimiento de la infraestructura. Cada dependencia realiza el pedido de lo que necesita para realizar sus labores, por ejemplo lapiceros, resma de papel, lápiz, sobres todo lo que tenga que ver con papelería y algunos insumos, en el almacén también se archiva y recopila toda la información sobre cada uno de los equipos de cada dependencia, como los inventarios, las hojas de vida.  

Entre las principales funciones se encuentra Realizar y Recibir pedidos para el suministro de los empleados, llevar inventario de cada una de los equipos y bienes de la ESE, estar al tanto de las necesidades e inconvenientes con los insumos de la ESE.